Университет, основанный в 1994 году, осуществляет свою деятельность на базе научно-исследовательских институтов Российской академии наук, а в самом образовательном процессе участвуют крупнейшие российские ученые. Основное отличие ГАУГН от других российских ВУЗов — реализуемое практическое объединение академической науки и университетского образования. Университет предоставляет три уровня образования: аспирант, магистр и бакалавр, а для поступления на бюджетное отделение, как заявили представители ГАУГН на Московском международном салоне образования, необходимо рекордно малое количество баллов.